麻醉科成立于1956年。在西南地区率先成立麻醉学教研室。1985年经国务院批准为硕士学位授予点。1999年经国家教委批准，正式成立重庆医科大学麻醉学系。2005年经国务院批准为一级临床医学学科博士点。
　　科室立足临床麻醉并已发展成为集医疗、教学、科研为一体的二级临床学科。是重庆及西南地区麻醉技术力量和麻醉学专业教学实力最雄厚的科室及系部之一。拥有全国第一个麻醉学教学实验室，一个重庆市级医学中心（重庆市第一个疼痛治疗中心）。已形成了较为完善的现代麻醉学科体系，即临床麻醉，急救与复苏，PACU，疼痛诊疗。　　全科有教授3位、副教授9位。博士导师1名、硕士导师7名。40岁以下师资均为博士和硕士。多人出国学习，目前有一名赴美国进行麻醉药理学的博士后研究。

　　麻醉科建制（亚学科）：　
　　1、临床麻醉（1956年成立）
　　2、体外循环学组（1979年成立）
　　3、疼痛诊治组—门诊及病房（1989年建立）
　　4、麻醉恢复室（1993年成立）
　　5、门诊无痛人流技术组（1998年成立）
　　6、术后自控镇痛组（2000年成立）
　　7、器官移植麻醉组（2002年成立）
　　8、2000年批准为重庆市疼痛治疗中心。
　　9、2005年负责组建重庆市麻醉质量控制中心。
　　10、2005年建立重庆市麻醉医师培训中心、重庆市麻醉住院医师培训基地。

　　麻醉科现状
　　1、是重庆直辖市麻醉技术力量最雄厚的科室之一。
　　2、临床医疗特色：完成各种临床麻醉近1000例，其中全麻率占50%以上。承担了大量的疑难危重病例麻醉。
　　3、科室学术风气浓厚，有制度化的业务学习、病历讨论、专家专题讲座，中、青年医生的学术报告和研讨会等。
　　4、教学体系
　　1983年成立硕士点，1986年获得硕士学位授权点。
　　1998年成立麻醉学系（本科）。
　　2000年设麻醉系临床麻醉学教研室 。
　　2005年成立博士点，2006年获得博士学位授权点。
　　承担了麻醉专业、定向及麻醉本科；硕士；博士；
　　医学本科、专科；医学七年制；外国留学生
　　护理大、中专、本科等教学工作。
　　科室拥有先进的麻醉设备和监测手段，为临床和科研提供了保证。

　　具有雄厚的师资力量和较高的科研水平，已为西南地区培养了数百名麻醉专业人员，培养了40余名硕士研究生，在国内各种期刊发表论文100余篇，同时还进行了广泛的国内外的学术交流。主编、参编了高等院校教材《外科学》、《麻醉并发症》、《麻醉生理学》、《静脉麻醉药理及临床应用》及《黄家驷外科学》、《妇产科理论与实践》等17部专业著作。