功能检查科是为了满足临床需要由内窥镜室、超声波诊断室和电生理室集中组建的医技科室。内窥镜室可分为消化和呼吸两个部分，消化方面内镜包括胃镜、肠镜和ERCP。胃镜为V型电子胃镜，管径细清晰度高。对于食管、胃、十二指肠球部的各种病变能准确诊断，并可用于上消化道出血胃镜下止血、胃镜下息肉摘除等治疗。纤维结肠镜能观察从肛门至回盲部，包括全部结肠病变，也能行镜下息肉摘除，止血等治疗。ERCP全称”经内镜逆行胰胆管造影”。目前，重庆市仅有几家医院拥有，对胰腺癌的诊断，梗阻性黄胆的鉴别诊断，或确定梗阻部位。肝、胆管疾病的诊断等有很高的价值，且可在镜下行经内镜胆管结石、取石等治疗。呼吸方面的内镜主要是纤维支气管镜。主要用于肺部包块的诊断和肺部感染的抽痰、灌洗。

　　超声波包括心脏彩超、腹部超声、经颅超声，其中惠普5500型彩色多谱勒超声心动图是目前最先进的超声设备之一，重庆市仅两台，能非常清楚地显示出心脏、血管各部位。对先心病、风心病、冠心病、血管内血栓有准确的检率；腹部超声能探测肝脏，胆囊、胰腺、脾脏、肾脏、前列腺、子宫附件等各种腹、盆腔脏器，对各种急性腹痛的鉴别诊断有重要价值；经颅多普勒可以探测脑部血流速度，发现颈椎病、脑动脉硬化等疾病。

　　电生理室包括心脏电生理和神经电生理两部分。伯利克7600平板运动机能检查出潜在的冠状动脉供血不足；DMSTO美国二十四小时动态心电监测，能长时间地监测心律失常，心肌缺血时段，大大提高拾出率，心电工作站包括十二导同步心电图、心室晚电位、心率变异性等，对预测心脏性猝死的危险性有重要意义；神经电生理包括脑电图、肌电图、视网膜电图、耳蜗电图、视觉听觉诱发电位、体感诱发电位，神经传导速度。成为神内、脑外、眼科、耳科、骨科疾病必不可少的检测手段，神经电生理已是现代医学的最重要进展之一。