中西医结合科与风湿病中心长期致力风湿病临床与科研，在类风湿关节炎的治疗方面处于国内先进水平，同时对强直性脊柱炎、骨关节炎、银屑病性关节炎、干燥综合征、赖特综合征、系统性红斑狼疮、系统性硬化症、皮肌炎、多肌炎及各种血管炎等风湿病也有较深入的研究，积累了丰富的临床经验。现有医疗用房面积1077平方米，展开病床46张。设有风湿病专科实验室，并配有关节镜、荧光生物显微镜、超激光治疗仪、红外热象仪、超低温冰箱、酶标仪等诊断治疗设备。目前已开展多种风湿病相关指标的检测，提高了强直性脊柱炎、系统性红斑狼疮、类风湿关节炎、骨关节炎等风湿病的早期诊断率。
   
　　科室目前主攻方向为类风湿关节炎等风湿病的中西医结合治疗。制定了早期诊断、系统治疗，局部与整体兼顾，内治与外治并举，中医与西医结合的类风湿关节炎诊治原则。针对难治性类风湿关节炎设计了序贯治疗方案，对长期治疗无效患者开展了关节腔内放射性同位素滑膜切除术及镜下滑膜切除等治疗，临床疗效显著。

　　2001年由方勇飞主任牵头成立的重庆中医药学会风湿病专委会对本地区的风湿病学发展起重要的推动作用。方勇飞主任还担任了中国中西医结合风湿病专业委员会副主任委员及中华中医药学会风湿病学会委员。
　　科室2002年获批为国家中医药管理局重点中西医结合风湿病专科建设单位，2005年获批为国家中医药管理局重点风湿病学科。
　　此外，科室在中医肝病、中医肿瘤、中医杂病、针灸等方面形成特色医疗项目，可以为患者提供多方位的中西医结合治疗与服务。中医肝病、肿瘤  我科有中医内科肝病学博士一名，并曾在上海中医药大学附属龙华医院中医肿瘤科进修学习，对肝炎、肝硬化等肝病及肺癌、肝癌、胃癌、卵巢癌等肿瘤的中西医结合治疗有丰富的临床经验。 中医杂病  我科开设了中医小儿、中医妇科专病门诊，开展了心血管系统、消化系统疾病的中西医结合治疗，均由临床经验丰富、具高级职称的中医专家应诊。特别对于小儿厌食、小儿哮喘等儿科疾病，月经不调、盆腔炎、产后乳汁少等妇科疾病，冠心病、慢性肺源性心脏病等心血管系统疾病以及慢性腹泻、便秘、消化不良等胃肠疾病的中西医结合治疗有较好的疗效。
　　针灸推拿
　　针灸室拥有经气导平仪、电针仪等治疗设备，主要采用体针、耳针、头皮针、艾灸、火罐、穴位注射、穴位贴线、挑治等综合疗法治疗各种疼痛、运动功能障碍性疾病（包括偏瘫、截瘫及周围神经损伤等的肢体运动功能障碍）、面神经炎、失眠、顽固性膈肌痉挛、便秘、泄泻、手术后腹胀、产后及术后尿潴留、急性扁桃体炎、麦粒肿、假性近视、荨麻疹、带状疱疹、斑秃等疾病，并开展了针灸减肥等治疗项目，取得了良好的疗效。擅长使用多种推拿手法治疗颈椎病、腰椎间盘突出、肩周炎、网球肘、膝骨关节炎等伤科痛症，对更年期综合征、月经不调等妇科疾病以及小儿遗尿、小儿消化不良等有较好的疗效。
      
　　辅助检查
　　科室已建立风湿病专科实验室，目前拥有荧光显微镜、倒置显微镜、酶标检测仪、高速离心机、蛋白电泳仪、超低温冰箱等实验设备，成功地开展与强直性脊柱炎、赖特综合征等脊柱关节病相关的HLA-B27检测多年，积累了丰富的经验。目前已开展类风湿关节炎早期诊断的抗体如抗角蛋白（AKA）抗体、抗环瓜氨酸肽（CCP）抗体，韦格纳肉芽肿特异性抗体——抗中性粒细胞胞浆（ANCA）抗体及慢性胶原病相关抗体如ENA抗体谱、PM-scl等的检测，可以提高此类疾病的早期诊断率，为临床早期治疗提供依据。
　　红外热像仪是针灸室的大型检查设备，该设备是接受人体表面辐射的红外线，通过计算机处理，转换成热像图，用来进行疾病的诊断与人体功能状态分析的一种无创性诊断仪器。适用于：
　　1、健康人群的普查；
　　2、肿瘤早期诊断；
　　3、血循环障碍判断；
　　4、炎症的诊断；
　　5、疼痛性疾病的诊断；
　　6、周围神经疾病的诊断；
　　7、烧伤面积及深度；
　　8、植皮治疗的监测。
　　通过大量的临床证明该检查对临床诊断有重要价值。